Pôvodne boli koncipované ako súčasť alchýmie alebo protovedy (predvedy), z ktorej sa neskôr vyvinula chémia. Až do 18. storočia sa spomínané symboly používali na označenie určitých prvkov a zlúčenín. Symboly sa v značkách alchymistov mierne líšili, takže tie, ktoré poznáme dodnes, sú výsledkom štandardizácie týchto značiek.
Podľa Paracelsa sú tieto znaky známe ako prvé tri:
soľ - označujúca základ látky - označené vo forme kruhu s jasne vyznačeným horizontálnym priemerom,
ortuť, čo znamená tekutú väzbu medzi vysokou a nízkou hodnotou, je kruh s polkruhom navrchu a krížikom dole,
síra - duch života - trojuholník spojený krížom.
Nasledujú symboly pre prvky zeme, všetky vo forme trojuholníkov:
Kovy označené symbolmi planét a nebeských telies:
Alchymistické symboly tiež zahŕňajú:
Ouroboros je had, ktorý žerie svoj vlastný chvost; v alchýmii symbolizuje neustále sa obnovujúci metabolický proces; je to dvojča kameňa mudrcov.
Heptagram - znamená sedem planét známych alchymistom v staroveku; ich symboly sú zobrazené vyššie.